我在百果园工作了6天，店长说要申请辞职，否则

如果你被扣除了10天工资，根据《劳动合同法》的相关规定，企业无权因员工正常辞职而扣发工资。你完全有权通过法律途径追回这些工资。首先，你可以尝试与企业协商解决；若协商无果，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求企业按承诺工资标准补足被扣发的部分。法律依据为《劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
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如果你决定辞职，为避免不必要的纠纷，应按照以下程序进行：1.提前书面通知店长或人力资源部门你的辞职意向，并保留好通知的证据；2.与企业协商确定最后工作日和工资结算等事宜；3.办理离职手续，如工作交接等。确保所有步骤都有明确的记录和沟通，以减少潜在的纠纷。
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从法律角度看，企业扣除你10天工资的做法不合法。根据《劳动合同法》的规定，企业无权因员工正常辞职而扣发工资。员工辞职是合法的权利，企业应当尊重并依法支付员工应得的劳动报酬。因此，你有权要求企业补足被扣发的工资，并可通过法律途径维护自己的合法权益。